Alates elementary OS 5.1'ts ja uuemast on Flatpaki tugi juba olemas. Eelvalimata rakenduste jaoks ava Flathub ja paigalda soovitud rakendus klõpsides suurel „Paigalda“ nupul ning seejärel ava allalaaditud „.flatpakref“ fail rakendusega Sideload.
Märkus: Kui oled juba paigaldanud ühe rakenduse eemalasuvast tarkvarahoidlast nagu Flathub, siis kõik muud sama tarkvarahoidla rakendused saavad olema leitavad rakenduses AppCenter.
